為鼓勵研究生跨域學習，本校創全國先例，修訂碩博士生雙主修法規，只要主修與加修系所簽訂共同指導論文合作協議，研究生就可用一本論文，通過兩個系所合辦的學位論文考試，取得雙碩士或雙博士學位。本所與政治學研究所率先簽訂碩士班合作協議，攜手培育具解決跨域問題的高階人才。

本校教務長李宗霖指出，研究生在學期間不僅專注專業養成，更需因應時代潮流跨域學習，「雙主修便是擴展專業知識領域的選擇之一」。目前國內各大學碩博士生若修讀雙主修，除需修滿主修和加修系所規定的課程與學分外，還需在主修與加修系所分別撰寫論文，依學位考試規定通過學位考核後，才能取得兩種碩士或博士學位。

「這項創舉是為了打破院所界線，希望培育碩博士生具備跨域多元知能。」李宗霖教務長進一步表示，本校率先修訂校內辦法，只要兩個研究所簽訂合作協議，修讀雙主修的研究生，在兩所各擇一位教授共同指導，論文主題與內涵符合雙方學術領域、且修課符合兩造規定，就可參加學位考試，通過後即可取得雙學位，「本校是全國第一所打破現有研究所專業框架的大專校院。」

本所所長胡念祖特聘教授特別指出，「雙聯碩士學位之構想發想於今年年初，在與政治所劉正山所長洽談後，發現雙方均有共同理念，又正逢學位授予法修正，使得校內系所間之雙主修成為可能，遂有此一全國開創性之作為出現」。胡所長期待，海事所之學生能藉此安排，強化國際關係等政治領域之學術訓練，而能擴張視野，增進海洋事務或海洋政策學中所要求之總體觀與涉外能力。

政治學研究所所長劉正山教授則看好兩個單位的合作綜效。劉所長特別說道：「 兩單位共同培養人才，能夠讓政研所師生的研究，朝向海洋相關議題擴展，不但可以讓國際關係、比較政治等課題更加『立體』，更能加強政治學研究生在全球議題上的宏觀、深度與論述能力。」

為培育跨域人才，本校同步建構完善的跨域學習資源網絡，提供整合學程及學系專業學程，透過跨領域共學群成立微學程，學生若修畢相關學程，學位證書上會加註，為學生履歷加值。學校同時開放多元專長事後申請制，學生修讀整合學程時，除事先申請，亦可採事後申請制度，經審查通過後發予證書，增加學生自由修課的彈性。